afavorov: (лампочка)
Как сделать копию внутри своего гугл-драйва (очень полезно, если хозяин файла хочет его стереть, чтобы не загромождал, а тебе самому файл нужен)
https://www.youtube.com/watch?v=r_Mah5RYOnE&noredirect=1
afavorov: (лампочка)
Этот код перегоняет RefSeq-вские имена изоформ в HGNC-шные имена генов.
afavorov: (лампочка)
Оказывается, для git svn clone надо адрес svn давать без двоеточия после имени хоста.

git svn clone svn+ssh://user@host/home/user/svnroot/trunk/project

При том что сам svn работает и так, и так.
svn ls svn+ssh://user@host:/home/user/svnroot/trunk/project
svn ls svn+ssh://user@host/home/user/svnroot/trunk/project

А если гиту с двоеточием команду дать, он говорит, что svn не авторизуется.

Network connection closed unexpectedly: Unable to connect to a repository at URL 'svn+ssh://user@host:/home/user/svnroot/trunk/project': To better debug SSH connection problems, remove the -q option from 'ssh' in the [tunnels] section of your Subversion configuration file. at /usr/lib/git-core/git-svn line 2299
afavorov: (лампочка)
Поиграл с DAS и BioMART - похоже, очень полезные сущности. Вот код, который вытаскивает все снипы из некоего интервала (1-й интрон REN, но это не важно), оставляет только A/G и T/C а потом проверяет, не образуется ли от замены сайт рестриции BGl1. Снипы вытаскиваются BioMART (это надстройка над DAS), а фланки - DAS.

И ещё - это вытаскивает все хромосомные полосочки из ENSEMBL, а это - из UCSC.
afavorov: (лампочка)
Если вам нужно по скайпу что-то передать тоновым набором, то для этого нужно вызвать dialpad. В последних версиях он почему-то пропал. Оказывается, что если нажать во время звонка кнопку D, то появляется кнопка для его вызова, такая же, как была в предыдущих версиях.
afavorov: (лампочка)
Вот такое заклинание в R
heatmap(as.matrix(X), scale='none')

нарисует то же самое, что и

Row.dendro <- reorder(as.dendrogram(hclust(dist(X))),rowMeans(X))
Col.dendro <- reorder(as.dendrogram(hclust(dist(t(X)))),colMeans(X))

heatmap(as.matrix(X), scale='none', Rowv=Row.dendro, Colv=Col.dendro)
Page generated Sep. 24th, 2017 01:54 pm
Powered by Dreamwidth Studios